Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b4Q8QZY9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sf3b4Q8QZY9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b4Q8QZY9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b4Q8QZY9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b4Q8QZY9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b4Q8QZY9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms