Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb12Q8K4N3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb12Q8K4N3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb12Q8K4N3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb12Q8K4N3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb12Q8K4N3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms