Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot6Q8K3P5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnot6Q8K3P5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnot6Q8K3P5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnot6Q8K3P5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnot6Q8K3P5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnot6Q8K3P5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnot6Q8K3P5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnot6Q8K3P5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms