Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HscbQ8K3A0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HscbQ8K3A0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HscbQ8K3A0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HscbQ8K3A0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HscbQ8K3A0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HscbQ8K3A0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HscbQ8K3A0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms