Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q7

Brox, BRO1 domain-containing protein BROX, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BroxQ8K2Q7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BroxQ8K2Q7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BroxQ8K2Q7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BroxQ8K2Q7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BroxQ8K2Q7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BroxQ8K2Q7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BroxQ8K2Q7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BroxQ8K2Q7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BroxQ8K2Q7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BroxQ8K2Q7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BroxQ8K2Q7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BroxQ8K2Q7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms