Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Depp1Q8K2F3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Depp1Q8K2F3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Depp1Q8K2F3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Depp1Q8K2F3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Depp1Q8K2F3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Depp1Q8K2F3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms