Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pnma3Q8JZW8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pnma3Q8JZW8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pnma3Q8JZW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pnma3Q8JZW8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pnma3Q8JZW8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pnma3Q8JZW8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pnma3Q8JZW8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pnma3Q8JZW8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pnma3Q8JZW8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pnma3Q8JZW8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pnma3Q8JZW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pnma3Q8JZW8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pnma3Q8JZW8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pnma3Q8JZW8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pnma3Q8JZW8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pnma3Q8JZW8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pnma3Q8JZW8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pnma3Q8JZW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pnma3Q8JZW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pnma3Q8JZW8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pnma3Q8JZW8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pnma3Q8JZW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pnma3Q8JZW8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnma3Q8JZW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pnma3Q8JZW8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnma3Q8JZW8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pnma3Q8JZW8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pnma3Q8JZW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pnma3Q8JZW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pnma3Q8JZW8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pnma3Q8JZW8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pnma3Q8JZW8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pnma3Q8JZW8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnma3Q8JZW8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnma3Q8JZW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pnma3Q8JZW8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pnma3Q8JZW8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnma3Q8JZW8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnma3Q8JZW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnma3Q8JZW8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnma3Q8JZW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnma3Q8JZW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnma3Q8JZW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnma3Q8JZW8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnma3Q8JZW8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnma3Q8JZW8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms