Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SbsnQ8CIT9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SbsnQ8CIT9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SbsnQ8CIT9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SbsnQ8CIT9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbsnQ8CIT9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SbsnQ8CIT9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SbsnQ8CIT9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SbsnQ8CIT9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.8 ms