Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CopaQ8CIE6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CopaQ8CIE6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CopaQ8CIE6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CopaQ8CIE6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CopaQ8CIE6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CopaQ8CIE6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CopaQ8CIE6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CopaQ8CIE6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CopaQ8CIE6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CopaQ8CIE6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CopaQ8CIE6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CopaQ8CIE6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CopaQ8CIE6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CopaQ8CIE6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CopaQ8CIE6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CopaQ8CIE6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms