Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mterf1aQ8CHZ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mterf1aQ8CHZ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mterf1aQ8CHZ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mterf1aQ8CHZ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms