Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGU1

Calcoco1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco1Q8CGU1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calcoco1Q8CGU1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calcoco1Q8CGU1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calcoco1Q8CGU1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calcoco1Q8CGU1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calcoco1Q8CGU1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Calcoco1Q8CGU1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calcoco1Q8CGU1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calcoco1Q8CGU1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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