Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEZ1

Smco1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco1Q8CEZ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smco1Q8CEZ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smco1Q8CEZ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smco1Q8CEZ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smco1Q8CEZ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smco1Q8CEZ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smco1Q8CEZ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smco1Q8CEZ1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smco1Q8CEZ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco1Q8CEZ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smco1Q8CEZ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smco1Q8CEZ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms