Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp27Q8CEG8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp27Q8CEG8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp27Q8CEG8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp27Q8CEG8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp27Q8CEG8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp27Q8CEG8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp27Q8CEG8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp27Q8CEG8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp27Q8CEG8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp27Q8CEG8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp27Q8CEG8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp27Q8CEG8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp27Q8CEG8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp27Q8CEG8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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