Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CrebrfQ8CDG5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CrebrfQ8CDG5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CrebrfQ8CDG5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CrebrfQ8CDG5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CrebrfQ8CDG5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CrebrfQ8CDG5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CrebrfQ8CDG5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CrebrfQ8CDG5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CrebrfQ8CDG5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CrebrfQ8CDG5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CrebrfQ8CDG5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CrebrfQ8CDG5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CrebrfQ8CDG5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CrebrfQ8CDG5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CrebrfQ8CDG5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms