Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CntrobQ8CB62 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CntrobQ8CB62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CntrobQ8CB62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CntrobQ8CB62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CntrobQ8CB62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CntrobQ8CB62 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CntrobQ8CB62 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CntrobQ8CB62 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CntrobQ8CB62 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CntrobQ8CB62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CntrobQ8CB62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CntrobQ8CB62 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CntrobQ8CB62 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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