Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfibp1Q8C8U0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ppfibp1Q8C8U0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfibp1Q8C8U0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp1Q8C8U0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp1Q8C8U0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp1Q8C8U0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp1Q8C8U0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfibp1Q8C8U0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppfibp1Q8C8U0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfibp1Q8C8U0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfibp1Q8C8U0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfibp1Q8C8U0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppfibp1Q8C8U0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms