Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm9999Q8C5Y2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm9999Q8C5Y2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm9999Q8C5Y2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm9999Q8C5Y2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm9999Q8C5Y2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm9999Q8C5Y2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm9999Q8C5Y2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm9999Q8C5Y2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm9999Q8C5Y2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm9999Q8C5Y2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm9999Q8C5Y2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm9999Q8C5Y2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm9999Q8C5Y2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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