Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5S7

Rec8, Meiotic recombination protein REC8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rec8Q8C5S7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rec8Q8C5S7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rec8Q8C5S7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rec8Q8C5S7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rec8Q8C5S7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rec8Q8C5S7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rec8Q8C5S7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rec8Q8C5S7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rec8Q8C5S7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rec8Q8C5S7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rec8Q8C5S7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rec8Q8C5S7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rec8Q8C5S7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rec8Q8C5S7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rec8Q8C5S7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rec8Q8C5S7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms