Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa22Q8C1N8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa22Q8C1N8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa22Q8C1N8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa22Q8C1N8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa22Q8C1N8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms