Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a2Q8BY89 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc44a2Q8BY89 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc44a2Q8BY89 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc44a2Q8BY89 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc44a2Q8BY89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms