Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Iffo1Q8BXL9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Iffo1Q8BXL9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Iffo1Q8BXL9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iffo1Q8BXL9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Iffo1Q8BXL9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Iffo1Q8BXL9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Iffo1Q8BXL9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Iffo1Q8BXL9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iffo1Q8BXL9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Iffo1Q8BXL9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Iffo1Q8BXL9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iffo1Q8BXL9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms