Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRT5

A830005F24Rik, RIKEN cDNA A830005F24, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A830005F24RikQ8BRT5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A830005F24RikQ8BRT5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A830005F24RikQ8BRT5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A830005F24RikQ8BRT5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A830005F24RikQ8BRT5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A830005F24RikQ8BRT5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms