Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c4Q8BMQ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c4Q8BMQ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c4Q8BMQ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c4Q8BMQ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c4Q8BMQ2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms