Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf18Q8BM39 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf18Q8BM39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prpf18Q8BM39 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prpf18Q8BM39 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prpf18Q8BM39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf18Q8BM39 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms