Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan12Q8BKT6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan12Q8BKT6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan12Q8BKT6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan12Q8BKT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan12Q8BKT6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan12Q8BKT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan12Q8BKT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan12Q8BKT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tspan12Q8BKT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tspan12Q8BKT6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tspan12Q8BKT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tspan12Q8BKT6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tspan12Q8BKT6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tspan12Q8BKT6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan12Q8BKT6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tspan12Q8BKT6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan12Q8BKT6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan12Q8BKT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tspan12Q8BKT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan12Q8BKT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tspan12Q8BKT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms