Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcfc2Q8BKT3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcfc2Q8BKT3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcfc2Q8BKT3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcfc2Q8BKT3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gcfc2Q8BKT3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gcfc2Q8BKT3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gcfc2Q8BKT3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gcfc2Q8BKT3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms