Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q8BGC1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8BGC1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8BGC1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q8BGC1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8BGC1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q8BGC1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Q8BGC1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Q8BGC1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Q8BGC1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q8BGC1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Q8BGC1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q8BGC1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q8BGC1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q8BGC1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q8BGC1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q8BGC1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q8BGC1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q8BGC1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Q8BGC1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q8BGC1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q8BGC1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8BGC1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q8BGC1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q8BGC1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q8BGC1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q8BGC1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8BGC1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms