Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfascQ810U3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfascQ810U3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NfascQ810U3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfascQ810U3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfascQ810U3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfascQ810U3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NfascQ810U3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfascQ810U3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms