Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NanogQ80Z64 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NanogQ80Z64 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NanogQ80Z64 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NanogQ80Z64 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NanogQ80Z64 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NanogQ80Z64 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NanogQ80Z64 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms