Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnphQ80U23 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SnphQ80U23 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SnphQ80U23 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SnphQ80U23 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnphQ80U23 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnphQ80U23 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SnphQ80U23 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SnphQ80U23 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnphQ80U23 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SnphQ80U23 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SnphQ80U23 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnphQ80U23 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SnphQ80U23 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SnphQ80U23 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnphQ80U23 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnphQ80U23 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms