Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ClmQ7TSN2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ClmQ7TSN2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ClmQ7TSN2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ClmQ7TSN2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ClmQ7TSN2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClmQ7TSN2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms