Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf2Q7TMI3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf2Q7TMI3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf2Q7TMI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf2Q7TMI3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf2Q7TMI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf2Q7TMI3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Uhrf2Q7TMI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Uhrf2Q7TMI3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Uhrf2Q7TMI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Uhrf2Q7TMI3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf2Q7TMI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf2Q7TMI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms