Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd3eapQ76KJ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3eapQ76KJ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3eapQ76KJ5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd3eapQ76KJ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd3eapQ76KJ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd3eapQ76KJ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd3eapQ76KJ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3eapQ76KJ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd3eapQ76KJ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3eapQ76KJ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3eapQ76KJ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd3eapQ76KJ5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms