Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RfflQ6ZQM0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RfflQ6ZQM0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RfflQ6ZQM0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RfflQ6ZQM0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RfflQ6ZQM0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RfflQ6ZQM0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RfflQ6ZQM0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RfflQ6ZQM0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RfflQ6ZQM0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RfflQ6ZQM0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RfflQ6ZQM0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RfflQ6ZQM0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RfflQ6ZQM0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RfflQ6ZQM0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RfflQ6ZQM0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RfflQ6ZQM0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RfflQ6ZQM0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RfflQ6ZQM0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms