Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tfap2eQ6VUP9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2eQ6VUP9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfap2eQ6VUP9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tfap2eQ6VUP9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2eQ6VUP9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2eQ6VUP9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2eQ6VUP9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms