Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Casc1Q6TDU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Casc1Q6TDU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Casc1Q6TDU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Casc1Q6TDU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Casc1Q6TDU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Casc1Q6TDU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Casc1Q6TDU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Casc1Q6TDU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Casc1Q6TDU8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Casc1Q6TDU8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Casc1Q6TDU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Casc1Q6TDU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Casc1Q6TDU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Casc1Q6TDU8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Casc1Q6TDU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Casc1Q6TDU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Casc1Q6TDU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casc1Q6TDU8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Casc1Q6TDU8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Casc1Q6TDU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms