Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a7Q6PGE7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a7Q6PGE7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc6a7Q6PGE7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc6a7Q6PGE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc6a7Q6PGE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc6a7Q6PGE7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc6a7Q6PGE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms