Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gramd2bQ6PEM6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gramd2bQ6PEM6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gramd2bQ6PEM6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gramd2bQ6PEM6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gramd2bQ6PEM6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gramd2bQ6PEM6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gramd2bQ6PEM6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gramd2bQ6PEM6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gramd2bQ6PEM6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gramd2bQ6PEM6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gramd2bQ6PEM6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gramd2bQ6PEM6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gramd2bQ6PEM6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gramd2bQ6PEM6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gramd2bQ6PEM6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gramd2bQ6PEM6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gramd2bQ6PEM6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gramd2bQ6PEM6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gramd2bQ6PEM6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gramd2bQ6PEM6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms