Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dtx4Q6PDK8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dtx4Q6PDK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dtx4Q6PDK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dtx4Q6PDK8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx4Q6PDK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dtx4Q6PDK8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dtx4Q6PDK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx4Q6PDK8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dtx4Q6PDK8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dtx4Q6PDK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms