Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rundc3bQ6PDC0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc3bQ6PDC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rundc3bQ6PDC0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rundc3bQ6PDC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rundc3bQ6PDC0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rundc3bQ6PDC0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rundc3bQ6PDC0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms