Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bhlhb9Q6PB60 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhb9Q6PB60 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bhlhb9Q6PB60 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bhlhb9Q6PB60 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bhlhb9Q6PB60 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bhlhb9Q6PB60 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bhlhb9Q6PB60 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bhlhb9Q6PB60 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms