Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2d40Q6P8N9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2d40Q6P8N9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2d40Q6P8N9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2d40Q6P8N9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp2d40Q6P8N9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp2d40Q6P8N9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2d40Q6P8N9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2d40Q6P8N9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyp2d40Q6P8N9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2d40Q6P8N9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2d40Q6P8N9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms