Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC061212Q6P8K3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC061212Q6P8K3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC061212Q6P8K3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC061212Q6P8K3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC061212Q6P8K3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC061212Q6P8K3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC061212Q6P8K3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms