Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnpo3Q6P2B1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnpo3Q6P2B1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnpo3Q6P2B1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo3Q6P2B1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo3Q6P2B1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnpo3Q6P2B1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnpo3Q6P2B1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnpo3Q6P2B1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnpo3Q6P2B1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnpo3Q6P2B1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnpo3Q6P2B1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnpo3Q6P2B1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnpo3Q6P2B1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnpo3Q6P2B1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms