Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn12Q6JVL5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn12Q6JVL5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lcn12Q6JVL5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lcn12Q6JVL5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lcn12Q6JVL5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lcn12Q6JVL5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn12Q6JVL5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn12Q6JVL5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn12Q6JVL5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcn12Q6JVL5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lcn12Q6JVL5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lcn12Q6JVL5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lcn12Q6JVL5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lcn12Q6JVL5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lcn12Q6JVL5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lcn12Q6JVL5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lcn12Q6JVL5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lcn12Q6JVL5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms