Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltbQ6IRU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltbQ6IRU5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CltbQ6IRU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CltbQ6IRU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CltbQ6IRU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CltbQ6IRU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms