Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt42Q6IFX2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt42Q6IFX2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt42Q6IFX2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt42Q6IFX2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt42Q6IFX2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt42Q6IFX2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt42Q6IFX2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt42Q6IFX2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt42Q6IFX2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt42Q6IFX2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt42Q6IFX2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt42Q6IFX2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt42Q6IFX2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt42Q6IFX2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt42Q6IFX2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt42Q6IFX2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms