Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
Brsk2Q69Z98 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brsk2Q69Z98 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brsk2Q69Z98 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brsk2Q69Z98 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brsk2Q69Z98 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brsk2Q69Z98 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brsk2Q69Z98 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Brsk2Q69Z98 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brsk2Q69Z98 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brsk2Q69Z98 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brsk2Q69Z98 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brsk2Q69Z98 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brsk2Q69Z98 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms