Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4eQ66X19 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrp4eQ66X19 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nlrp4eQ66X19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp4eQ66X19 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4eQ66X19 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4eQ66X19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp4eQ66X19 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp4eQ66X19 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp4eQ66X19 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms