Protein–RNA interactions for Protein: Q64701

Rbl1, Retinoblastoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbl1Q64701 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbl1Q64701 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rbl1Q64701 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbl1Q64701 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbl1Q64701 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbl1Q64701 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbl1Q64701 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rbl1Q64701 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbl1Q64701 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms